我为甲方，在店铺合作期间为分成问题违约，然后我在与房东沟通续租问题时，乙方直接跟房东从新签约，现在说店铺归他所有

如果原合作合同未解除，且你与房东的租赁关系仍在有效期内，乙方未经你同意擅自与房东重新签约，可能构成对你的违约。你可以根据原合同约定，要求乙方承担违约责任，同时你有权继续履行与房东的原租赁合同。

首先，你违约在先有过错，但乙方直接绕过你与房东重新签约并说店铺归他，得看你们合作协议咋约定的。若协议没赋予他单独续约权，他这么做就不合理。你可先和乙方协商，表明店铺合作情况，争取达成新分成或续约方案；协商不成，收集合作协议、沟通记录等证据去法院起诉，维护自己权益。

你好！合同有约定的按照合同约定，协商不成可以向法院起诉，提交民事起诉状、证据材料、双方的身份资料。