公司被收购了，部分股东对收购方案不满意，该怎么提出异议，保护自己的合法权益

这种的话只有开股东会决议进行表决来进行重大事项表决的确定。

若部分股东对公司收购方案不满意，可先查阅公司章程，看其中对异议提出及权益保护有无规定。可在股东大会上明确表达异议，要求详细解释方案。也可联合其他有相同意见的股东，增加话语权。若沟通无果，可依据《公司法》等法律，通过书面函件向收购方和公司董事会提出诉求。若自身权益确实受损，可考虑向法院提起诉讼，要求撤销不合理的收购方案或获得合理补偿。

根据《公司法》第八十九条规定，若公司被收购属于合并、分立或转让主要财产等情形，对股东会该项决议投反对票的股东可自决议作出之日起 60 日内与公司协商，要求公司以合理价格收购其股份，协商不成的，可在决议作出之日起 90 日内向法院提起诉讼。