我妹妹未成年怀孕了，然后在医院生了个孩子，出生的时候建档有填写了孩子父亲的信息，但是出生第二天孩子他爸就被警方带走了，判了三四年的牢，目前是服役中，但是出生证明需要孩子父亲签字，但是男方直系亲属不愿意给我们做监狱会见证明，没办法进去找孩子父亲签字，我们想要做单亲家庭，但是医院那边说，第一次建档的时候已经是填写了孩子父亲，所以后面办理出生证明跟户口的话是需要孩子父亲签字，没有签字的话没办法处理，也没办法删除建档父亲的一列，这个的话可以原建档信息删除，重新提供证明到医院重新建档吗

首先可以和医院进一步沟通，说明男方服刑无法签字的实际情况，争取医院通融。若医院坚持，可尝试向法院申请宣告男方失踪或因不可抗力无法履行签字义务，凭借法院文书要求医院处理。若医院仍不配合，可考虑向卫生健康行政部门反映情况。不建议直接删除原建档信息重新建档，因为可能涉嫌提供虚假信息，有法律风险。

从法律和流程角度，一般医院建档信息删除、重新建档较难随意操作，可尝试联系当地卫健委等主管部门，说明特殊情况（未成年、父亲服刑且亲属不配合），看是否有特殊流程或证明替代方式，比如由司法部门协调监狱，让孩子父亲远程确认等，也可再找专业律师深入分析当地具体规定和可行途径 。

一般情况下，医院的建档信息不能随意删除和重新建档。若想更改，需证明信息错误等特殊情况，建议咨询当地卫生健康部门或寻求法律援助，看是否有合法途径解决出生证明办理难题。